Dirigent 

Flemming Windekilde er uddannet på Musikvidenskabeligt Institut (Københavns Universitet) og i dirigentklassen på Det kgl. Danske Musikkonservatorium af bl.a. professorerne Dan-Olof Stenlund, Arne Hammelboe og Jorma Panula.

Flemming Windekildes erfaringer som dirigent spænder vidt: Concord Brassband (1987-89), Unge Akademikeres Kor (siden 1988) Aalborg Symfoniorkester, Storstrøms Amts Kammerensemble, Athelas, vokalgruppen Ars Nova og senest er Flemming Windekilde blevet tilknyttet Radiokammerkoret ved flere projekter.

Desuden har han dirigeret flere musikdramatiske opsætninger, f.eks. Soap Opera af T.S. Høeg, Videooratorium af kunstnergruppen Holland House, Bent Lorentzens Tristan-Variationer og Gudruns 4. Sang, der var en af de største opsætninger i København under Kulturby '96. Flemming Windekilde dirigerer Kammerkoret Hymnia og har gjort det siden koret blev grundlagt i 1983.
Flemming Windekilde blev leder for Sankt Annæ Gymnasiekor i 2001.